تشكل لجان فرعية مختلفة بهدف المساعدة في تحقيق أهداف وخطط عمل النظام الصحي الأكاديمي وفقًاً للاستراتيجية الشاملة التي تم وضعها لهذا النظام، وتشتمل عضوية اللجنة على عدة شخصيات من تخصصات مختلفة، وسيكون من بينهم ممثلين عن كل الهيئات والمؤسسات الشريكة في النظام الصحي الأكاديمي.