قام المشرفون على النظام الصحي الأكاديمي بوضع مجموعة من الأهداف الطموحة التي يمكن تحقيقها، ولتحقيق هذه الأهداف تم تصميم وتطوير برامج تتلاءم مع المحاور الستة التي يرتكز عليها النظام الصحي الأكاديمي والمتمثلة في الطب، والتعليم ، والبحوث، ومشاركة المجتمع، والموارد البشرية، وأنظمة المعلومات.
